1990年9月11日，在金門戰地的晨曦中，一場因兩起遣返船難事件引發的秘密會談、一次為后來兩岸事務性商談樹立經典模式的談判，正悄悄地舉行，從此開啟了兩岸會談的歷史帷幕。
9月12日，《金門協議》在金門簽署，開創了兩岸會談的模式，兩岸攜手共同打擊犯罪掀開了嶄新的一頁。
背景
兩岸自己的事情不要到別人家談
兩起悲劇，兩岸商討改進的辦法。在哪里商談？大陸反對在第三地，郝柏村敲定在金門
1990年發生了兩起海上慘案。7月22日，臺灣當局將渡海入臺的大陸同胞裝進漁船底艙遣返，用6寸長釘釘死，25人被悶死在船艙。8月13日，臺海軍押送福建漁船駛回福建，軍艦與漁船相撞，遣返的人中有21人溺斃。
據樂美真披露，兩起慘案之后，兩岸紅十字組織頻繁互通電話，商討今后改進之法，也在探索見面商談的渠道。繼臺方提出“中線交接”“、第三地研究”的思路后，雙方的聯系進入了實質性探討。大陸提出自己的看法，“兩岸自己的事情，不要到別人家去談”。
陳長文透露一段秘辛，兩岸協議敢選定金門簽署，是時任“行政院長”郝柏村的果斷提議。
陳長文回憶，當雙方同意談判時，在一個星期天，他打電話向郝柏村報告進度并提及正在考慮談判地點問題，郝柏村問：“為什么不到金門來？”但1990年是“動員戡亂”時期，金門是戰地，大陸紅十字會的朋友理應多是共產黨員，“在金門和共產黨接觸”涉及“叛亂”，是何等“危險”的事。陳長文當時追問：“院長，是真的嗎？”郝柏村在電話另一頭說：“為什么不可以？”他轉念一想，金門機密且隱秘，確是談判好地方，他再問一次：“院長，您確定？”郝柏村馬上回答：“當然！”1990年9月1日晚，臺灣方面表示，雙方可以在金門會談。
時任臺軍金防部司令的李禎林指出，1990年8月底接獲軍方密令，表示兩岸將在金門會談，一切行政支持都由金防部負責。當時上層還親自致電指示細節，強調兩岸會談非同小可，“務必力求隱秘”。
